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apd:lezioni0809

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Massimo Coppola
Linea 22: Linea 22:
   * ** Esercitazione: implementare una applicazione basata su pipeline e farm in MPI **   * ** Esercitazione: implementare una applicazione basata su pipeline e farm in MPI **
  
-  * **12/03** __MPI: comunicatori e gruppi__ Creazione, modifica e distruzione di gruppi e comunicatori (completamento locale vs globale). Operazioni collettive in MPI: semantica, ordinamento totale, indipendenza dall'implementazione, esempi di implementazione e di stallo. Eccezione: MPI_Barrier.\\ (MPI_Group_size,  MPI_Group_rank,  MPI_Group_translate_ranks,  MPI_Group_compare, MPI_Comm_group, MPI_Group_union, MPI_Group_intersection, MPI_Group_difference, MPI_Group_incl, MPI_Group_excl, MPI_Group_free; MPI_Comm_size, MPI_Comm_rank, MPI_Comm_compare, MPI_Comm_dup) +  * **12/03** __MPI: comunicatori e gruppi__ \\ Creazione, modifica e distruzione di gruppi e comunicatori (completamento locale vs globale). Operazioni collettive in MPI: semantica, ordinamento totale, indipendenza dall'implementazione, esempi di implementazione e di stallo. Eccezione: MPI_Barrier.\\ (MPI_Group_size,  MPI_Group_rank,  MPI_Group_translate_ranks,  MPI_Group_compare, MPI_Comm_group, MPI_Group_union, MPI_Group_intersection, MPI_Group_difference, MPI_Group_incl, MPI_Group_excl, MPI_Group_free; MPI_Comm_size, MPI_Comm_rank, MPI_Comm_compare, MPI_Comm_dup) 
  
 ^Rif. | MPI standard 2.1 sezioni 6 -> 6.2, 6.3.1, 6.3.2 (parte), 6.3.3, 6.4.1, 6.4.2 (parte), 6.4.3, 5.1 | ^Rif. | MPI standard 2.1 sezioni 6 -> 6.2, 6.3.1, 6.3.2 (parte), 6.3.3, 6.4.1, 6.4.2 (parte), 6.4.3, 5.1 |
  
-  * **13/03** __MPI: operazioni collettive__  Significato, semantica non sincronizzante, ordinamento dei messaggi. Collettive per intra-comunicatori. MPI_Barrier, MPI_Broadcast, MPI_Gather, MPI_Scatter, MPI_Gatherv, MPI_Scatterv, MPI_Allgather, MPI_Allgatherv, MPI_Alltoall, MPI_Alltoallv, MPI_Alltoallw+  * **13/03** __MPI: operazioni collettive__  \\ Significato, semantica non sincronizzante, ordinamento dei messaggi. Collettive per intra-comunicatori. MPI_Barrier, MPI_Broadcast, MPI_Gather, MPI_Scatter, MPI_Gatherv, MPI_Scatterv, MPI_Allgather, MPI_Allgatherv, MPI_Alltoall, MPI_Alltoallv, MPI_Alltoallw
  
 ^Rif. | MPI standard 2.1 sezioni 5 -> 5.2 (non 5.2.2), 5.3 - 5.8 | ^Rif. | MPI standard 2.1 sezioni 5 -> 5.2 (non 5.2.2), 5.3 - 5.8 |
  
-  * **19/03** __MPI: operazioni collettive__  Collettive con comunicazione e calcolo: reduce e parallel prefix. Operatori predefiniti; Minloc e Maxloc. Definizione di operatori utente. Primitive MPI: MPI_Reduce e MPI_Allreduce, MPI_Reduce_scatter, MPI_Scan+  * **19/03** __MPI: operazioni collettive__  \\ Collettive con comunicazione e calcolo: reduce e parallel prefix. Operatori predefiniti; Minloc e Maxloc. Definizione di operatori utente. Primitive MPI: MPI_Reduce e MPI_Allreduce, MPI_Reduce_scatter, MPI_Scan
  
 ^Rif. | MPI standard 2.1 sezioni 5.9 - 5.12 (non 5.11.2)| ^Rif. | MPI standard 2.1 sezioni 5.9 - 5.12 (non 5.11.2)|
  
-  * **20/03** __Esempi di applicazioni__ Sample sort parallelo. Algoritmo di Strassen. Calcolo dell'insieme di Mandelbrot (cenni); algoritmo K-means e sua parallelizzazione elementare.+  * **20/03** __Esempi di applicazioni__ \\ Sample sort parallelo. Algoritmo di Strassen. Calcolo dell'insieme di Mandelbrot (cenni); algoritmo K-means e sua parallelizzazione elementare.
  
 ^Rif. | [[http://www.di.unipi.it/~coppola/didattica/ccp0506/papers/Kumar-textbook-samplesort.pdf|Sample sort parallelo]] | dal testo //Introduction to Parallel Computing// A. Grama, A. Gupta, G. Karypis, V. Kumar.  | ^Rif. | [[http://www.di.unipi.it/~coppola/didattica/ccp0506/papers/Kumar-textbook-samplesort.pdf|Sample sort parallelo]] | dal testo //Introduction to Parallel Computing// A. Grama, A. Gupta, G. Karypis, V. Kumar.  |
 ^ | [[http://www.di.unipi.it/~coppola/didattica/ccp0506/papers/dhillon-modha-corretto_parkmeans.ps|Dhillon, Modha Technical Report su K-means parallelo]] | A Data-Clustering Algorithm On Distributed Memory Multiprocessors. I.S. Dhillon, D.S.Modha, LNAI 1759, pag 245. **Nota:** la versione disponibile online via LNCS riporta un algoritmo errato, il technical report è corretto. | ^ | [[http://www.di.unipi.it/~coppola/didattica/ccp0506/papers/dhillon-modha-corretto_parkmeans.ps|Dhillon, Modha Technical Report su K-means parallelo]] | A Data-Clustering Algorithm On Distributed Memory Multiprocessors. I.S. Dhillon, D.S.Modha, LNAI 1759, pag 245. **Nota:** la versione disponibile online via LNCS riporta un algoritmo errato, il technical report è corretto. |
 ^ | [[http://www.di.unipi.it/~coppola/didattica/ccp0506/papers/i0871.pdf|Ottimizzazioni sequenziali e parallele per K-means]] | Large-Scale Parallel Data Clustering. Dan Judd, Philip K. Mckinley, Anil K. Jain. Ieee Transaction On Pattern Analysis And Machine Intelligence, Vo. 20, No. 8 August 1998. | ^ | [[http://www.di.unipi.it/~coppola/didattica/ccp0506/papers/i0871.pdf|Ottimizzazioni sequenziali e parallele per K-means]] | Large-Scale Parallel Data Clustering. Dan Judd, Philip K. Mckinley, Anil K. Jain. Ieee Transaction On Pattern Analysis And Machine Intelligence, Vo. 20, No. 8 August 1998. |
 +==== Programmazione a skeleton paralleli, ASSIST ====
  
 +  * **17/04** __Skeleton Paralleli e Programmazione Parallela Strutturata__ \\ Richiami agli skeleton paralleli, caratteristiche dei linguaggi/ambienti di programmazione a skeleton. Discussione sulle fondamentali per l'espressività e l'implementazione (linguaggi funzionali/imperativi; approccio procedurale/oggetti/componenti; gradi di separazione degli aspetti parallelo e sequenziale del programma; supporto su macchine virtuali JVM, mono/.NET). Sistemi a skeleton di seconda generazione. \\ Due alternative di implementazione: template e data-flow. Muskel, approccio macro-dataflow, strategia di compilazione ed esecuzione, estendibilità dell'insieme di skeleton, possibilità di implementazione di token repository distribuiti. \\ ASSIST : obiettivi, approccio a linguaggio di coordinamento parallelo + linguaggi sequenziali ospiti; compilazione e meta-compilazione. 
  
-==== Programmazione a skeleton paralleli, ASSIST ==== +^ Rif. | [[http://homepages.inf.ed.ac.uk/mic/Pubs/manifesto.pdf|Bringing]] -- M. Cole, //Bringing skeletons out of the closet: pragmatic manifesto for skeletal parallel programming//, Parallel Computing 30 (2004) 389–406| 
-==== Sistemi operativi distribuitiGrid e Cloud ==== +^ | [[http://www.kfa-juelich.de/nic-series/volume33/803.pdf|2ndGen]] -- M. Danelutto, //”Second-generation” Skeleton Systems//, in Parallel Computing: Current & Future Issues of High-EndComputing, Proceedings of the International Conference ParCo 2005 | 
-==== Parallelismo su chipCPU multi-core e GPU computing ====+^ | [[http://www.scpe.org/vols/vol08/no4/SCPE_8_4_01.pdf|muSkel]]  -- M. Aldinucci, M. Danelutto and P. Dazzi, //Muskel: an expandable skeleton environment// (2007)in: Scalable Computing: Practice and Experience, 8:4(325-341) | 
 +^ ^ ** Tutorial di ASSIST ** ^ 
 +^ | {{ccp:tutorial_assist_03_2007.pdf|Tutorial ASSIST Febbraio 2007}} | 
 +^ | {{:ccp:descrizioneloader1.1.pdf| GEAversione Novembre 2006}} | 
 +^ | {{:ccp:assisttutorial_02_2008.pdf|Tutorial ASSIST Febbraio 2008}} | 
  
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-==== Elenco delle lezioni previste ancora da effettuarsi==== 
  
-I giorni 26 27/3 __NON__ ci sarà lezione. +  * **23/04** __ASSIST : panoramica e semantica essenziale__ \\ Evoluzione dell'approccio parallelo strutturato legata alle griglie ed all'adattività: da P3L, a SkIE, ad ASSIST. Semantica funzionale pura, skeleton rigidi. Processo di compilazione due fasi, uso di compilatori convenzionali (gcc) come back-end e/o librerie (MPI) per il supporto al parallelismo.  ASSIST: approccio a moduli paralleli e canali, con parallel skeleton “generico” configurabile. Grafo di moduli di programma non ristretto: cicli e archi multipli. Concetto di parmod come skeleton "configurabile" (meta-skeleton). Meccanismo di compilazione a due fasi e integrazione di linguaggi sequenziali diversi in compilazione. Blocchi fondamentali: moduli sequenziali e proc. Implementazione delle interfacce tra linguaggi, uso del sistema di tipi CORBA in ASSIST.
-  * <del>02/04</del>+
  
 +^ Rif. | [[http://www2.computer.org/portal/web/computingnow/0409/whatsnew/cise|Un articolo recente da Computing Now]]| Joel Falcou //Parallel Programming with Skeletons// |
  
-  * **16/04** +  * **24/04, 28/04** //(preliminare per le due lezioni)// \\ //ASSIST: // Panoramica della semantica base del parmod : sezioni di ingresso e uscita con guardie, distribuzioni e collezioni, set di processori virtuali. Composizione di costrutti paralleli e livelli di annidamento, collegamento a formalismi a componenti. Parmod, esempi: input e output section; topologia (array, none, one) e concetto di processore virtuale (VP); distribuzioni (broadcast, on demand, scatter) e collezioni (from any, from all); parallelismo task-parallel (topologia none) e data-parallel (topologia array), definizioni dei VP associate. Processori Virtuali e Deployment. Struttura dell'applicazione multi architettura come albero di directory; metadati di descrizione dell'applicazione, elementi del linguaggio ALDL; processi, attributi dei processi (vincoli hardware e software), vincoli collettivi (coallocazione), esistenza di vincoli specifici di ASSIST. Server di deployment: GEA, accenni alle versioni precedenti, confronto con i caricatori MPI; obiettivi (generalità, portabilità, eterogeneità dei supporti) e schema base (parse/query/filter/map/deploy); cenni di deployment tramite middleware di griglia. 
-  * **17/04** +  * **30/04** //(preliminare)// \\ //Esempi di programmazione in ASSIST// 
-  * **23/04** + 
-  * **24/04** +  * **05/05** 
-  * **30/04** + 
-  * **07/05** +  * **08/05** //Data Mining Parallelo : componenti algoritmiche, regole di associazione, classificazione, clustering//
-  * **08/05**+
   * **14/05**   * **14/05**
-  * **15/05**+==== Sistemi operativi distribuiti, Grid e Cloud ==== 
 +  * **15/05** Sistemi operativi distribuiti e di griglia. Il progetto XtreemOS 
 +  * **19/05** Il progetto XtreemOS (2)
   * **21/05**   * **21/05**
   * **22/05**   * **22/05**
 +
 +
 +==== Parallelismo su chip: CPU multi-core e GPU computing ====
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 +==== Elenco delle lezioni previste ancora da effettuarsi ====
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 +I giorni 26 e 27/3 __NON__ ci sarà lezione.
 +  * <del>02/04</del>  <del>16/04</del> <del>07/05</del>
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apd/lezioni0809.1239867322.txt.gz · Ultima modifica: 16/04/2009 alle 07:35 (13 anni fa) da Massimo Coppola